Le problème est finalement tout simple à résoudre. Mais il m'a fallut pas mal de recherche pour trouver la solution.
Le moniteur de ressources utilise /usr/syno/sbin/snmpd pour fonctionner.
Cacti utilise /opt/sbin/snmpd.
Les deux utilisent le port 161 pour fonctionner et c'est là le problème.
Il suffit simplement d'indiquer au module net-snmpd installer via ipkg d'utiliser un autre port. Il faut pour cela ajouter dans le fichier /opt/etc/snmpd.conf la ligne suivante, dans la section "Access Control Setup :
agentaddress 127.0.0.1:10161
Dans Cacti, il faut modifier le port et y indiquer 10161.
Un redémarrage du Syno et le moniteur refonctionne.